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冠軍出爐！『數(shù)源杯』百萬單細胞基因表達數(shù)據(jù)算法大賽圓滿落幕

來源：今日商訊時間：2021-08-17 16:26:11

8月16日，由深圳國家基因庫主辦，深圳華大生命科學(xué)研究院、深圳市華大基因?qū)W院、深圳市猛犸公益基金會協(xié)辦，DataCastle承辦的"數(shù)源杯"百萬單細胞基因表達數(shù)據(jù)算法大賽決賽在深圳國家基因庫順利舉行。

經(jīng)過初賽、復(fù)賽的嚴(yán)格評審篩選，10支隊伍從300余個參賽團隊中脫穎而出進入本次的最后決戰(zhàn)。經(jīng)過激烈角逐決出最終結(jié)果：來自華中科技大學(xué)的柳嘉鑫同學(xué)一舉奪魁，另外9支來自浙江大學(xué)、波士頓大學(xué)、西安交通大學(xué)等高校或機構(gòu)的隊伍分別榮獲二、三等獎和優(yōu)秀獎。

"數(shù)源杯"百萬單細胞基因表達數(shù)據(jù)算法大賽于5月17日正式開啟，鼓勵相關(guān)領(lǐng)域的研究人員和從業(yè)者以國家基因庫生命大數(shù)據(jù)平臺存儲的百萬單細胞數(shù)據(jù)資源為基礎(chǔ)，針對“聚類”這一單細胞數(shù)據(jù)分析的重要步驟，進行單細胞聚類算法的開發(fā)和優(yōu)化，進而打造能夠降低內(nèi)存占用、提升運算速度的優(yōu)質(zhì)計算工具;與此同時，為生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)、計算機科學(xué)等多領(lǐng)域的專業(yè)人才提供跨領(lǐng)域、跨學(xué)科的技術(shù)交流平臺。本次大賽吸引了國內(nèi)外100余家知名高校和近90家企事業(yè)單位的專業(yè)技術(shù)人員參與，包括北京大學(xué)、清華大學(xué)、波士頓大學(xué)、費城兒童醫(yī)院、中科院計算所、解放軍總醫(yī)院、華為、騰訊、百度、平安科技等。累計提交作品1819個。

重磅開場

下午兩點，決賽正式開始，華大集團聯(lián)合創(chuàng)始人、董事、理事長楊煥明院士和深圳國家基因庫主任王韌博士分別發(fā)表寄語和致開幕辭。楊煥明院士在寄語中指出生命的基本結(jié)構(gòu)/功能單位是細胞，今天我們做單細胞研究就是把細胞水平和基因?qū)用娴难芯拷Y(jié)合起來。同時他還對選手們提出期望：“在這次的競賽中你們每一個人都是勝利者，我更希望在你們中涌現(xiàn)出一些高手，改變我們對生命的認(rèn)識，改變現(xiàn)有生命解碼工具!”

王韌博士在致辭中首先代表深圳國家基因庫向為本次大賽提供支持的所有單位、社會團體及個人表示衷心的感謝。他表示入圍決賽的10支隊伍是充滿創(chuàng)造力和活力的，他們勇于瞄準(zhǔn)科技前沿，迎難而上，搶占先機，用自己的智慧為我國單細胞研究工作貢獻力量。接下來他還指出生物學(xué)大廈不是一個人建立的，只有各位年輕的生物工作者通力合作，才能實現(xiàn)學(xué)術(shù)上的重要突破。“今天不只是一個比拼的戰(zhàn)場，更是一個交流的平臺，希望各位能在今天的比賽中激發(fā)新的靈感，擦出不一樣的火花!”

精彩答辯

浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院郭國驥教授、清華大學(xué)古槿副教授、哈工大(深圳)-奇安信數(shù)據(jù)安全研究院韓培義副院長、深圳華大生命科學(xué)研究院劉石平博士和國家基因庫生命大數(shù)據(jù)平臺負責(zé)人魏曉鋒坐鎮(zhèn)擔(dān)任決賽評委，進入決賽的10支隊伍分別對各自的算法模型展開精彩論述。值得一提的是，現(xiàn)有百萬單細胞聚類算法的平均運算時長為6~8小時，復(fù)賽階段排名第一的隊伍已經(jīng)將此時長縮短到0.3小時，大大提升了計算效率。

每支參賽隊伍論述結(jié)束后，評委專家進行提問，隨后從算法模型創(chuàng)新性、架構(gòu)設(shè)計、復(fù)雜度以及答辯過程的PPT陳述、邏輯性等方面進行評分。本次大賽的最終評分由線上得分和答辯得分兩部分組成，按二者加權(quán)后的最終得分進行排名。

上圖：答辯現(xiàn)場

10支參賽隊伍答辯完成后，韓培義副院長作為專家代表、深圳華大生命科學(xué)研究院徐訊院長作為大賽首席科學(xué)家分別為本次大賽進行了總結(jié)和展望。韓培義副院長指出計算機技術(shù)正在與其他學(xué)科交叉，尤其是生物學(xué)。他鼓勵大家善用公共數(shù)據(jù)庫(例如國家基因庫生命大數(shù)據(jù)平臺)的數(shù)據(jù)和算力資源將想法付諸實踐。徐訊院長表示BT與IT融合(生物與信息融合)是“十四五”國家重點研發(fā)計劃，本次競賽就是利用IT解決BT問題的實際應(yīng)用。他還指出接下來數(shù)源杯還計劃圍繞時空組技術(shù)數(shù)據(jù)解析問題發(fā)起競賽，期待有越來越多不同學(xué)科背景的人才參與進來，共同推進BT與IT融合創(chuàng)新。

冠軍出爐

經(jīng)過激烈的角逐，本次大賽的結(jié)果正式揭曉：

上圖：參賽選手與評委專家云合影。本次決賽根據(jù)國家疫情防控要求，嚴(yán)格控制參會人數(shù)，以“線上+線下”相結(jié)合的形式進行。

至此"數(shù)源杯"百萬單細胞基因表達數(shù)據(jù)算法大賽圓滿落幕。參賽選手們紛紛表示這既是一場有意義的競賽，也是一次非常有趣的跨學(xué)科交流會，讓計算機、數(shù)學(xué)、生物學(xué)等多學(xué)科背景的專業(yè)人才在此碰撞出新的數(shù)據(jù)分析思路。

未來，國家基因庫將基于國家基因庫生命大數(shù)據(jù)平臺的數(shù)據(jù)和算力資源，以解決多組學(xué)數(shù)據(jù)分析難點問題為目標(biāo)，持續(xù)舉辦數(shù)源杯系列大賽。通過跨領(lǐng)域人才的交流協(xié)作，促進生物學(xué)與其他學(xué)科的交叉融合，推動更多組學(xué)數(shù)據(jù)計算工具的開發(fā)及應(yīng)用，為科學(xué)研究及產(chǎn)業(yè)發(fā)展帶來新視角。

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